Esta nueva entrega de la serie Saber Marionette J, que tiene lugar unos meses después de la serie OVA, sigue las aventuras de Otaru y su clan de abnegadas y obsesivas marionetas. Esta vez, el malvado Fausto está de vuelta, y de nuevo juega con la tecnología de las marionetas que nunca se quiso explorar. Las Muñecas Sable están de vuelta, y se debaten entre su nuevo amor por Otaru y su lealtad eterna a Fausto. ¿Serán capaces Otaru, Lime, Cherry y Bloodberry de detener a Fausto de nuevo, o irán todas a la chatarra?