Kono Oto Tomare!: Segunda Temporada sigue la historia de Takezou Kurata, un joven que se une al club de koto (instrumento tradicional japonés) en su último año de secundaria. Con la ayuda de sus compañeros de club, incluido su rival, Chika Kudou, juntos buscan preservar la tradición del koto y competir en el Festival Nacional de Música. La segunda temporada continúa con el club de koto tratando de mejorar y superarse a sí mismos mientras enfrentan desafíos y aprenden más sobre la música y sobre sí mismos.