Readaptación de la serie manga principal, Himura Kenshin es un vagabundo con un pasado oscuro y una disposición soleada. No un ronin sino un rurouni, nunca fue un samurái, sino un asesino de gran habilidad en la restauración Meiji, que en el punto de inflexión de la guerra simplemente se alejó. Sus viajes lo llevan a Tokio en el año 11 de la era Meiji, donde se hace amigo de una maestra de Kendo, una ex ladrona, una camorrista y una doctora, todas con sus propios secretos. Juntos luchan contra los enemigos que emergen del oscuro pasado del que Kenshin no puede escapar.

Ryza es una chica normal y corriente. Cansada de la aburrida vida del pueblo, se escapa de él para reunirse con sus buenos amigos en un lugar secreto para hablar de sus sueños y planear emocionantes aventuras. Un día, la decidida Ryza y compañía deciden dirigirse a la prohibida "isla del otro lado de la costa" como primer viaje de exploración. Junto con el alquimista y otros amigos que conocen allí, viven una "aventura de verano" que nunca olvidarán.

Es el decimosexto año de la era Meiji. Han transcurrido cinco años desde que Kenshin Himura detuvo la rebelión de Makoto Shishio. Aunque las llamas de su incipiente revolución se extinguieron, las cicatrices que dejó a su paso aún se sienten en todo Japón. Restos de su grupo todavía existen, aunque dispersos. Algunos han encontrado la paz, mientras que otros continúan luchando. Después de que una facción remanente intentara reavivar la revolución, la antigua espada de Shishio cayó en manos de Ashitarou Hasegawa, un niño huérfano que nunca conoció un hogar. El conflicto también dejó a Aran Inoue, un joven de 16 años mitad japonés y mitad estadounidense, y a una mercenaria llamada Asahi Kubota con un alto precio que pagar, sin ningún otro lugar al que ir. Pero, afortunadamente para estos individuos, el dojo Kamiya siempre ha sido un lugar que acoge a los sin techo sin indagar en su pasado.

El reino de Metallicana está bajo ataque por los Cuatro Señores del Caos. Este grupo de villanos, el maestro ninja Gara, la emperatriz del trueno Nei Arshes mortal, el frío y calculador Kall-Su y el enigmático sacerdote oscuro Abigail, no se detendrán ante nada para conseguir lo que quieren, incluso si eso significa la destrucción total a su paso. El sumo sacerdote Geo está desesperado por ayudar a salvar el reino y a su gente. Desata al poderoso mago Dark Schneider, un hombre que solía ser aliado de los villanos. Desafortunadamente, Dark Schneider tiene sus propios planes en mente. ¿Detendrá a los Cuatro Señores del Caos o se unirá a ellos en su conquista del mundo?